Ο 2ος αιώνας π.Χ χαρακτηρίζεται από την κατοχή της Ζακύνθου από τους Ρωμαίους. Το νησί κυβερνιέται σύμφωνα με το ρωμαϊκό δίκαιο, αργότερα όμως αυτονομείται και οι κάτοικοι πληρώνουν έναν φόρο υποτέλειας στη Ρώμη ενώ τους παρέχουμε και άνδρες για τις λεγεώνες τους. Οι Ρωμαίοι ήταν οι πρώτοι κατακτητές της Ζακύνθου και θεωρούσαν το νησί στρατηγικό σημείο για να προωθήσουν τα εμπορικά τους συμφέροντα και την επεκτατική τους πολιτική.
Οι Ζακυνθινοί πολλές φορές επαναστάτησαν γιατί δεν δέχονταν τους Ρωμαίους αλλά με τον ερχομό του Λεύϊνου, ναύαρχου των Ρωμαίων, η τάξη αποκαταστάθηκε στο νησί. Στη συνέχεια οι σχέσεις ανάμεσα στους Ζακυνθινούς και τους Ρωμαίους καλυτέρευσαν και κατάφεραν να αποκρούσουν μαζί και εξωτερικούς κινδύνους.
Ο χριστιανισμός διαδόθηκε στο νησί και μάλιστα αναφέρεται ότι ήρθε η ίδια η Μαρία η Μαγδαληνή το 34 μ.Χ για να κηρύξει την νέα θρησκεία. Την περίοδο της παρακμής της ρωμαϊκής αυτοκρατορίας η Ζάκυνθος δοκιμάστηκε σκληρά από επιδρομές βαρβάρων.